以Roche公司的454技術(shù)、Illumina公司的Solexa技術(shù)和ABI公司的Solid技術(shù)為標志的第二代測序技術(shù)被稱為下一代測序技術(shù)(next generation sequencing,NGS)在極大降低了測序成本的同時,還大幅提高了測序速度,并且保持了高準確性,在病原微生物的快速檢測、溯源及傳染病性疾病防控等公共衛(wèi)生方面發(fā)揮越來越大的作用。
454技術(shù)的發(fā)明人之一Jonathan Rothberg還發(fā)明了一種基于半導(dǎo)體芯片的測序技術(shù)-Ion Torrent。該項技術(shù)僅在信號檢測方面與454技術(shù)有所不同,在測序過程中不是通過檢測焦磷酸熒光顯色,而是通過檢測H+信號的變化來獲得序列堿基信息。該技術(shù)使用了一種布滿小孔的高密度半導(dǎo)體芯片,可以檢測反應(yīng)池中的pH值的變化。當離子感受器感受到H+信號,H+信號再轉(zhuǎn)化為數(shù)字信號,從而讀出DNA序列。Ion Torrent相比于其他測序技術(shù)來說,不需要昂貴的成像設(shè)備,因此,設(shè)備成本較低,測序速度快,整個上機測序可在2~3.5 h內(nèi)完成,ABI公司基于Ion torrent 平臺推出的Ion Proton與S5測序平臺,通量15Gb的通量,運行時間7h,對應(yīng)的病原微生物二代測序試劑盒和分析解讀軟件,實現(xiàn)了臨床檢測的高度自動化和標準化。